Муниципальное образование город-курорт Анапа включает в себя город Анапу, 10 сельских округов и 50 сельских населенных пунктов.

В составе Анапы – ряд курортных поселений, среди которых: села Витязево, Большой Утриш и Сукко, поселок Джемете, станица Благовещенская.

Анапская – станица, основанная в 1836 году как Николаевская, в честь царя Николая I, который посетил Анапу в 1837 году. Заброшена в годы Кавказской и Крымской войн. В 1867 году основана вновь как Анапская. В настоящее время лидер по количеству населения среди сельских населенных пунктов района.

Алексеевка – стремительно растущий микрорайон вдоль трассы «Анапа – Анапская», в прошлом – поселок. Названа в честь казачьего генерала Алексея Даниловича Бескровного, отличившегося при взятии Анапы в 1828 году. В 2009 году планируется начало строительства школы и детского сада.

Благовещенская – станица, основанная в 1836 году, названа в честь православного праздника – Благовещения. В будущем именно на территории станицы появится первая в России свободная экономическая зона туристско-рекреационного типа «Новая Анапа».

Витязево – курортное село, названное в честь майора Витязя, совершившего свой подвиг в августе 1809 года. После взятия русскими войсками турецкой крепости Анапа в ней был оставлен гарнизон, которому приходилось постоянно сдерживать набеги черкесов. В 1837 году была основана казачья станица Витязевская, которая была оставлена во время Крымской войны (1854). В 1862 году на месте станицы возникло первое в Кубанской области компактное поселение понтийских греков – село Витязево. По сей день многие дома украшены колоннами и античными статуями, что делает село похожим на античный город.

Джемете – курортный поселок, расположенный вдоль песчаных барханов, с адыгейского переводится как «золотая россыпь».

Гайкодзор – село, которое славится национальным армянским колоритом. В 2008 году открыт армянский культурный центр «Арин Берд», в переводе – «крепость на крови», который стал одним из экзотических объектов туристического показа.

Гостагаевская – старинная казачья станица, основанная в 1862 году, название из-за одноименной реки Гостагайки. Неоднократно завоевывала статус «самого благоустроенного сельского поселения муниципального образования».

Сукко – курортное село, на территории которого располагается Федеральный детский оздоровительно-образовательный центр «Смена». Обладает галечным пляжем.

Утриш – курортное село. Известно благодаря крупному дельфинарию, а также уникальным можжевеловым лесам, чистым галечным пляжам, среди которых есть и нудистские.

Юровка – село, бывшее имение Управляющего Черноморским округом, генерала Дмитрия Пиленко, названо в честь его сына Юрия Пиленко, отца Елизаветы Юрьевны Кузьминой-Караваевой (Матери Марии).